ncbiblast使用方法

2017年12月21日—解决方法,首先用conda安装对应的模块,然后修改update_blastdb.pl的第一行,即shebang部分,以conda的perl替换,或者按照如下方法执行。perl`which ...,2020年3月20日—BLAST是生命科学研究中常用的一套在蛋白质数据库或核酸数据库中进行序列相似性比对的一套分析工具。英文全称是BasicLocalAlignmentSearchTool。,这时候,我们需要利用BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)工具对这条序列进行序列比对(ali...

这或许是我写的最全的BLAST教程

2017年12月21日 — 解决方法,首先用conda安装对应的模块,然后修改 update_blastdb.pl 的第一行,即shebang部分,以conda的perl替换,或者按照如下方法执行。 perl `which ...

如何使用NCBI进行blast比对

2020年3月20日 — BLAST是生命科学研究中常用的一套在蛋白质数据库或核酸数据库中进行序列相似性比对的一套分析工具。英文全称是Basic Local Alignment Search Tool。

如何使用NCBI进行序列比对(alignment)?

这时候,我们需要利用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)工具对这条序列进行序列比对(alignment),即在已知的一个序列数据库中,找到相似或者一致的序列。通过 ...

2.1 序列比对- Blast使用指南

Blast 使用指南 ; 1. 了解存储sequence的常用文件格式 ; FASTA格式(.fasta or .fa ) ; 2. 安装blast及其子程序blastn, blastp,blastx, ... ; 3. 阅读命令帮助

NCBI BLAST比对结果详细分析

写在解读报告之前的,首先就使用Blast最终的目的是什么达成一致,Blast是通过两两比对,找到数据库中与输入序列最相似的序列,或者说是最相似的序列片段。那么我们看比对 ...

NCBI在线BLAST使用方法与结果详解

1,进入在线BLAST界面,可以选择blast特定的物种(如人,小鼠,水稻等),也可以选择blast所有的核酸或蛋白序列。不同的blast程序上面已经有了介绍。这里以常用的核酸库 ...

BLAST+ 的安裝與基礎使用

... ncbi-blast-2.13.0+/bin` 如果下載的是`.rpm` 檔,用`rpm -ivh` 指令安裝即可。 裝好之後,就可以在電腦用指令來做序列比對了。 這是平常在比對序列的時候,自己常用的 ...

NCBI使用教程:基因序列对比最快的方法

2021年11月2日 — BLAST是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的缩写。是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的一个基于序列相似性的 ...

序列比對

2017年10月25日 — BLAST全名Basic Local Alignment Search Tool,是一種用來對比對序列一級結構,在蛋白質database或DNAdatabase中進行相似性的比較。10/12日的課堂介紹 ...

NCBI

本文详细描述了如何使用NCBI的blast功能比对查询基因信息,通过图解的方式提供操作流程报告和结果数据分析。